CDD

Développement de webservices en java + interface web HTML/Jquery

Ingénieur en ingénierie logicielle

Description du projet

Environnement fonctionnel

GenPhySE est une unité de recherche dont les travaux vont de la gestion des populations
animales (ovins, caprins, lapins, palmipèdes, porcs) à l'évaluation et la conception de
systèmes d'élevage plus durables.
L’équipe Informatique & Automatismes contribue aux travaux de recherche par le
développement d’outils de collecte de données et de systèmes d’informations. Parmi ces
outils, le système d’informations Sicpa (Système d’Information et de Calcul pour la
Phénotypage Animal) Sanitaire permet aux élevages expérimentaux de l’Inra de gérer tous les
aspects sanitaires de leurs troupeaux : gestion de la pharmacie, suivi sanitaire des animaux,
gestion de la prophylaxie, ... Une application client/serveur est développée et mise à
disposition des agents des unités expérimentales pour enregistrer et exploiter ces données. De
plus, une application web est déployée afin d’offrir une interrogation des données pour les
scientifiques des unités de recherche.
Parallèlement, l’ontologie AHOL (Ontologie pour la santé animale du bétail) apporte la
connaissance sur les maladies de production (symptômes, agents pathogènes, espèces
concernées, ...).
La personne recrutée intégrera l’équipe Informatique & Automatismes. Sa mission sera
d’enrichir l’application web destinée aux scientifiques en apportant des nouveaux critères de
recherche basés sur l’ontologie. Il s’agira donc de développer des web services issus de
AHOL, développer des requêtes croisées entre l’ontologie et les données de Sicpa Sanitaire et
intégrer le tout dans l’IHM déjà existante.

Ingénieur en génétique quantitative

Mission et Activité

Au sein de l’équipe Génétique et Sélection des Petits Ruminants (GESPR) de l’UMR GenPhySE de Toulouse, l’Ingénieur(e) participera au développement de nouveaux modèles d'évaluations génétiques en caprins laitiers, dans le cadre du projet CASDAR RUSTIC en partenariat avec l'UMT GPR (Génétique pour un élevage durable des Petits Ruminants). Il (elle) sera en charge de l’adaptation d'un nouveau modèle d'évaluation génétique pour les caractères de production laitière prenant en compte l'ensemble des mesures réalisées en ferme lors du contrôle laitier des lactations. Ce modèle (Test-day model) permet d'estimer simultanément les effets génétiques et d'environnement qui modulent ces caractères tout au long de la lactation des animaux.

Vous serez plus particulièrement chargé(e):

  • d'adapter un modèle existant pour la quantité de lait produite à un contexte de contrôle laitier ne mesurant qu'une traite journalière au lieu de deux;
  • d'adapter ce type de modèle aux caractères de production de matière grasse et protéique;
  • de comparer la persistance laitière calculée par ce modèle et celle obtenue par un critère synthétique à la lactation;
  • d'assurer une veille scientifique et technologique;
  • de diffuser et valoriser les résultats sous forme de rapports techniques, de publications ou de présentations orales.

Profil recherché

Formation recommandée : Ingénieur en école d'agriculture ou d'agronomie, Master 2 en statistiques appliquées
Connaissances souhaitées : Anglais écrit et oral ; Maîtrise de la programmation sous R et/ou SAS
Aptitudes recherchées : Goût prononcé pour l'analyse de données, la modélisation et la génétique quantitative

Modalités d’accueil

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