HDR - Estimation de l’histoire évolutive des populations à partir de données génomiques : développements statistiques et applications aux espèces animales d’élevage

Mon projet scientifique concerne le développement de méthodes statistiques pour l’analyse de données en génétique des populations, et leur application à des jeux de données issus de la génétique animale. Les méthodes que je développe ont pour objectif de reconstruire l'histoire évolutive d'une espèce à partir de données génomiques issues d'individus de cette espèce. Un premier volet de mes travaux concerne l'estimation des processus démographiques (ou neutres) de cette évolution, comme les variations de taille efficace ou la structuration de l'espèce en populations. Un deuxième volet concerne la détection de régions du génome dont l'évolution ne résulte pas uniquement de ces processus neutres, mais également de pressions adaptatives. En terme d'applications, je m'intéresse plus particulièrement aux espèces d'élevage dans lesquelles je cherche à documenter les processus de domestication ou de sélection intensive récente.