Chargé de Recherches

L'objectif général de l'équipe "Génétique et Epigénétique moléculaires des espèces animales utilisées en croisement" (GenEpi) de l'UMR1388 GenPhySE est de caractériser les différentes sources d’information moléculaire transmises entre générations qui contribuent à la variabilité des caractères observée chez les animaux domestiques. Afin de progresser dans les études génétiques basées sur des analyses d’association pangénomiques, les approches de génétique systémique visent à établir le lien entre génome et phénome en exploitant l’information sur les phénotypes moléculaires intermédiaires. Cette stratégie bénéficie des données -omiques produites en quantité grâce à l’essor des technologies de séquençage haut-débit et des démarches de science ouverte, qui rendent ces données accessibles pour diverses espèces. Il conviendra d'évaluer l'apport d'une approche inter-espèces dite translationnelle pour améliorer les mécanismes moléculaires impliqués dans l'élaboration de caractères complexes.

Vous développerez une approche de génétique systémique translationnelle, en analysant et transférant des connaissances obtenues chez différentes espèces, pour décortiquer finement les relations génome-phénome dans les espèces d’élevage étudiées dans l’équipe. L'objectif finalisé sera d'étendre cette démarche pour explorer le déterminisme de caractères nouveaux et peu connus, comme les comportements qui peuvent contribuer aux capacités adaptatives des animaux et à leur bien-être. Dans ce cas, l’acquisition de données phénotypiques et de facto de données moléculaires -omiques est un facteur limitant, et une plus-value est attendue des approches de génétique systémique translationnelle.

Your aim will be to have a better understanding of how dietary substrates shape the metabolic activity of microbiota for the production of bioactive metabolites. You will work in a multidisciplinary team of 20 people, including cell biologists, physiologists, microbiologists and bioinformaticians, using your skills in bacterial metabolic engineering (identification of microbial metabolic pathways and in vitro culture of candidate bacteria).

Initially, you will focus on the identification of microbial genes involved in the utilization of nutritional substrates. You will complement these approaches with in vitro culture of candidate bacteria, i.e. expressing the genes of interest, to produce the bioactive metabolites.

In the longer term, you will further explore the physiology and metabolism of these bacterial key species of the gut microbiota, in order to help to define nutritional programming strategies favourable to their development within the gut microbiota and ultimately favourable to the health of the host animal.

Interested? Contact us (sylvie.combes dot inrae.fr) and visit the INRAE Jobs website from now until 2 March 2023 to apply!
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Activités-clés et compétences-cibles

Les nouveaux outils de la génomique permettent une meilleure connaissance du génome des animaux d'élevage. Ils modifient les méthodes de gestion génétique des populations. Le / la lauréat(e) développera des méthodes d'optimisation des stratégies de sélection et de gestion de la variabilité génétique dans les populations sélectionnées en prenant en compte différents types d'informations et d'outils génomiques. L'optimisation sera envisagée sur le plan génétique et économique, avec des perspectives d'applications à différentes espèces animales, en particulier les ovins où cohabitent une filière riche (ovins laitiers) assez similaire aux bovins laitiers et une filière (ovins allaitants) avec de fortes contraintes économiques. Ce poste contribuera aux recherches de l'institut sur métaprogramme Sélection génomique (SelGen). Le/la lauréat(e) sera intégré(e) au sein d'une équipe de méthodologie où il bénéficiera d'un encadrement de la part de chercheurs à forte visibilité internationale.

Formations recherchées

Doctorat ou équivalent. Des compétences en génétique quantitative et/ou génétique des populations et/ou programmation et/ou en statistique sont souhaitées. L'aptitude à travailler en équipe est recommandée. La maîtrise de l'anglais est souhaitée. Les lauréats qui n'auraient pas encore eu d'expérience postdoctorale devront réaliser un séjour, de préférence à l'étranger, à l'issue de l'année de stage et avant le passage en CR1